尽管大雨和夜色成功掩护了法军的进攻，但同样大大延迟了炮兵向前的推进速度。之前，为了迷惑英国人，令敌方指挥官误判法军的主攻方向，拿破仑故意将大部分火炮撤出与小直布罗陀要塞对峙的炮垒群。而如今，朱诺率领的重炮部队依然在后方的泥地里拼命挣扎，已经无法依照预定时间抵达战斗岗位。
拿破仑看了看怀表，已接近凌晨二时，他摇了摇头，对着骑兵指挥官说：“缪拉，我的朋友，我的亲人，没时间了！倘若我回不来，请代我照顾好波拿巴家族。”
时间紧迫，已不容下拿破仑的犹豫之心。那是他深知阿勒芒德将军的北非舰队正准备进行封堵内港航道，如果他们的企图被守卫拉塞因半岛的英军察觉，并对峡口实施火力封锁，原本就异常艰难的航道“堵塞战术”将无法获得成功。
在经历过无数磕磕碰碰之后，拿破仑非常清醒的意识到巴黎在各个方面都远不如兰斯。所以，等到英国人被赶出土伦和地中海之后，安德鲁统一法国的步伐将变得势不可挡。所以，他必须抛弃之前自己左右徘徊的立场，竭其所能，在赢得土伦战役的同时，配合兰斯海军将英国地中海舰队主力全部留在土伦内港（小锚地），继而给法兰西共和国（或是王国）的未来统治者立下一个好印象。
不久，巴拉吉耶和厄吉利特这两座要塞附近响起了隆隆炮声，数十门火炮闪出的火光照亮了英国守军的阵地。那是第一与第二纵队在第二次尝试强攻敌方堡垒，竭力将小直布罗陀要塞的英军吸引到左右两翼，为主力部队创造战机。
战斗前，拿破仑骑马回到主力纵队那边。他策马转身，在面对狂风暴雨之下瑟瑟发抖的两千五百名士兵时，一言不发的跳下马，将缰绳丢给赶来的传令兵，独自走到士兵们中间。拿破仑对着部下们大声说道：
“士兵们，共和国的公民们，
伟大的法兰西正期待着我们创造新的历史！
你们听到了什么，是滂沱的雨声，还是隆隆的枪炮声？
不，不对，那是祖国在呼唤英雄的名字！
是你，来自马蒂格的农夫，弗拉西斯！
是你，艾克斯城的鞋匠，皮埃尔！
也是你，马赛的守墓人，克雷曼特！……”
拿破仑一边走，一边准确无误的叫出他身边士兵的籍贯，职业与名字。
“战争嘛，是会死人的。当然你们会怕，事实上我也很害怕。然而，拿下那座堡垒是共和国军人的职责，义不容辞的使命！
所以，我必须去，即便你们不愿意，我也要独自攻下堡垒。
相信我，胜利女神就站在堡垒那边等着我，所以子弹会从我身上弹开，大炮会因为我的勇敢而选择转弯！
现在，我愿意分享大家这份荣耀，但你们必须紧紧的跟着我，跟在我身后。”
说道这里，拿破仑走出从士兵中间走到最前列，他跳上战马，冲着士兵们高喊一句：“排出攻击阵列！”于是，所有人自觉的依照军官们的指令在行动。
发出进攻指令前，拿破仑想到了两年前安德鲁统帅在国民公会门前的那番讲演词，他再度回身冲着士兵们喊道：“
如果我在向前冲，请紧紧跟随我；
如果我转身逃跑，请开枪打死我；
如果我不幸阵亡，请务必为我报仇，报仇！”
说完，拿破仑下达了最后的进攻命令，他骑行在队列的最前排，身边仅有一名传令官。
战斗一开始，中路纵队就打得非常激烈。尽管两翼部队进攻多面堡的战斗一直持续着，但并没有降低英国人对小直布罗陀的防御力量。
所以，中路法军在进攻时，仍然遭到了英军的顽强抵抗。整连整连的法军在黑暗、混乱与枪炮声中迷失了方向。英国人依托预先构筑的障碍物和防御工事，负隅顽抗，猛烈还击，一排排的法国士兵倒在英军的猛烈炮火与排枪之下。
在小直布罗陀要塞下方，到处都是阵亡法军士兵的尸体，以及倒地哀嚎的伤员。就连拿破仑的坐骑也被流弹击中而倒地死亡。但他迅速站了起来，指挥士兵继续往前冲击，却突然感到左小腿一阵剧烈的疼痛。